La plateforme eMundus comprend une palette riche de fonctionnalités, chacune activable selon les besoins, dont le paiement en ligne. Il est possible de proposer un montant à régler différent selon certaines informations renseignées par un candidat (ex : le montant à payer va être différent si le candidat est boursier ou s'il est non-boursier), pour s'acquitter des frais de candidature. La fonctionnalité peut aussi être utilisée pour qu'un candidat procède au règlement des frais d'inscription ou de réinscription.